Proje ile birlikte, birçok hastalık riski ve genetik faktör hakkında daha fazla bilgi edinildi. Bu sayede, erken teşhis ve tedavi için testler geliştirildi ve özel ilaçlar üretilerek hastalıkların tedavi edilmesi için daha etkili yollar keşfedildi. Özellikle kanser tedavisindeki son yıllardaki gelişmelerin büyük bir kısmı, insan genomunun daha iyi anlaşılması sayesinde gerçekleştirildi.
Ayrıca, genetik danışmanlık hizmetleri sayesinde de insanlar, genetik hastalıkların riskini öğrenerek gerektiğinde önlem alabilecekleri veya tedaviyi planlayabilecekleri bilgiye sahip oldular. Bu, ailelerdeki genetik hastalıkların neden olduğu psikolojik travmaların da önüne geçmeye yardımcı oldu.
İnsan Genom Projesi'nin tamamlanması ayrıca, kullanılabilir kaynakların sınırlı hale geldiği günümüzde gıda üretiminde de büyük bir etki yarattı. Bitkilerin, hayvanların ve bakterilerin genetik yapısının daha iyi anlaşılması ile birlikte, daha verimli ve daha dayanıklı bitkiler üretilerek küresel açlık sorununun çözümüne katkı sağlandı.
Sonuç olarak, İnsan Genom Projesi'nin tamamlanması, tıp ve tarım gibi birçok alanda büyük bir ilerleme sağladı ve insan sağlığı ve hayat kalitesini büyük ölçüde artırdı. Ancak, bu teknolojilerin kullanımı etik tartışmalara da yol açtı ve bu nedenle, gelişmelerin sosyal, etik ve yasal boyutları dikkate alınarak yönetilmelidir.